Masuzoe, kamuya ait fonları kişisel tatiller, sanat eserleri ve çocuklarına aldığı çizgi romanlar için harcadığı iddiaları üzerine istifa ettiğini açıkladı. 

Yasalara aykırı davranmadığını savunan Masuzoe, harcamalarında bazı hatalar yaptığını ise kabul etti. 

İstifası 21 Haziran’da resmiyet kazanacak Masuzoe'nin ABD ve Avrupa ülkelerine iş ziyaretleri sırasında lüks otellerde kaldığı, hafta sonu sayfiye yerlerine giderken de resmi aracını kullandığı ortaya çıkarılmıştı. 

Tokyo Belediye Meclisi, kamuya ait fonları kişisel harcamaları için kullandığı ileri sürülen Masuzoe hakkında soruşturma başlatmıştı. Masuzoe, mecliste yapılan oylamada üyelerin güvenoyunu alamamıştı. 

2020'de Olimpiyat Oyunları'na ev sahipliği yapmaya hazırlanan Tokyo'nun valiliğini yapan Masuzoe'nun ağustos ayında Brezilya'nın Rio de Janeiro kentinde yapılacak Olimpiyatlar'ın açılış törenine katılması ve kapanışta da Olimpiyat Bayrağı'nı teslim alması bekleniyordu. 

Masuzoe’nun selefi Naoki Inose, Tokyo’nun 2020 Olimpiyatlar'ına ev sahipliği yapmasında önemli rol oynamış ve hakkında çıkarılan benzer iddialar üzerine 2013’te istifa etmişti. Inose'nin özel bir hastaneden 50 milyon yen (yaklaşık 465 bin dolar) rüşvet aldığı ileri sürülmüştü, 

Daha önce Sağlık Bakanı olarak görev yapan Masuzoe, 2014'te Inose'nin yerine Tokyo valisi atanmıştı.

AA